Японский институт физико-химических исследований в Иокагаме (Japan’s Institute of Physical and Chemical Research – RIKEN), японское отделение компании Silicon Graphics (SGI Japan) и корпорация Intel объявили о создании самого мощного суперкомпьютера в мире. Теоретическое пиковое быстродействие компьютера составляет 1 петафлопс (один миллион миллиардов операций с плавающей точкой в секунду).
Компьютер получил название MDGRAPE-3 или Protein Explorer – Исследователь белковых структур. Эта компьютерная система предназначена для моделирования межатомных и межмолекулярных взаимодействий.
Система объединяет 201 устройство, каждое из которых содержит 24 чипа MDGRAPE, разработанных исследователями RIKEN. Эти микропроцессоры предназначены для молекулярного динамического моделирования. Эти устройства соединяются с 64 параллельными серверами, каждый из которых содержит 256 ядер Intel Xeon 5000, и с 37 параллельными серверами, каждый из которых содержит 74 ядра Xeon 3,2 гигагерца.
В будущем ученые RIKEN планируют дальнейшее развитие системы на основе процессоров Xeon 5100.
Тест производительности LINPACK, который стандартно используется при определении места компьютера в списке Top 500 List, не может напрямую использоваться при тестировании системы MDGRAPE-3. Этот компьютер нельзя с помощью теста LINPACK прямо сравнить с самыми быстрыми суперкомпьютерами в мире. Однако теоретическое пиковое быстродействие, составляющее 1 петафлопс может твердо поставить систему MDGRAPE-3 на первое место в списке мощнейших компьютеров мира. Его быстродействие в три раза превышает мощность самого быстрого компьютера в мире – лидера списка Top 500 компьютера корпорации IBM BlueGene/L, установленного в Ливерморской Национальной Лаборатории (Lawrence Livermore National Laboratory). Пиковое быстродействие IBM BlueGene/L составляет 367 терафлопс.
Официальная демонстрация системы MDGRAPE-3 состоится 24 июня в лаборатории RIKEN в Иокагаме.